在《航海王热血航线》中除了玩家之间的对抗，还有着一同组队挑战的团队副本，其中雷霆之怒团本则是能够获得非常多秘宝装备的地方。在玩家等级到达一百级的时候就可以在团队挑战中找到，雷霆之怒副本是和毒潮推进每周轮换的，除了等级的要求在战力上也是需要最少达标，才能有着更好的挑战。在奖励上能够获取超凡品质的风暴秘宝，无论是精炼进阶还是强化，都能很大程度提升玩家的战力。在角色的选择上主C必然是需要一个强力的输出位，其中红发杰克斯是首选的版本大C，在100爆伤的属性下是能打出180e的超高伤害，无论是聚怪还是续航、破霸都是不在话下，对于当前团本的通关有着很大的帮助。新世界路飞也是有着不错的输出，不过需要顶上战争女帝的辅助，才能打出最大的实力，所以在选用新世界路飞的时候，要进行合理的搭配。其次黑胡子、赤犬这些备选也是有着不错的实力。
在辅助的选择如果玩家有红发作为主C，辅助的搭配思路则是完全围绕红发进行，例如携带雷利在徽章上提供一定的切割增伤，以及特性的切割增伤，是能够让红发得到更大的输出，不过要是其他的主C是无法迟到雷利的伤害加成。在心系里有着典藏品质的夏日清凉娜美能够为全队提供增伤，以及攻速移速的增加，是能够让队伍手感更优的不错选择。像这样能为全队带来的收益还有很多选择，例如甚平、汉库克、新世界罗宾等等，不过这些角色也是需要在有特殊的主C情况下是有着更大的作用。在副本通关流程中开局可以选择不同的boss来击败，完成不同的路线任务也是能得到一个主动技能，击败阿悟是需要在一定时间内聚怪，同时清理掉所有的球云，如果任务不达标则是会出现球龙，在地面会出现红圈需要玩家即使躲避。在组队上可以有两个人选择此路线，在角色搭配上是需要一个副C加一个对应辅助，同时球龙也是需要其他玩家支援才能通关，总体是比较费时的副本。
耶摩则是更推荐控制多的辅助来攻破，任务重要求在进度条出现后，使用不同的技能攻击阻止其破坏遗迹，所以控制能力强的辅助就可以轻松完成任务。瓦帕则是推荐主C来进入攻破，这个副本就是看玩家的硬实力，在副本里需要在一定时间击败对手，可以优先打掉小怪来降低其防御，之后只要输出到位就可以通过。在第二阶段就是四人一同进入攻破的boss艾尼路，在技能上红色区域即使躲避也是不用多说的，及能力落雷的机制是需要玩家站到光柱，需要玩家站光柱才可以避免落雷的伤害。二阶段的艾尼路机制也是差不多，出红圈、出人群，以及通过闪避来清除层数，只要合理的搭配就能很好的通过副本了。